웸블리 스타디움에서 리버풀을 상대로 커뮤니티 쉴드를 들어올리며 시즌 시작은 훌륭했었으며 19/20 시즌은 그의 효과적인 골 퍼레이드를 입증할 또 다른 시즌이 될 것으로 보였습니다. 하지만 시즌 중 2번의 부상으로 인해 아게로의 개인적인 발전을 더디게 만들었습니다.
그럼에도 불구하고 2개의 기록을 경신하였으며 다음 시즌 그가 빛나는 모습으로 경기장에 돌아올 것이라는데 의심을 하지 않습니다.

2019년 10월 19일, vs 아탈란타,
UEFA 챔피언스리그
맨체스터 시티는 UEFA 챔피언스리그에서 아탈란타와 격돌하였고 에티하드 스타디움에서 5골을 넣으며 상대를 꺾을 수 있었습니다. 경기에서 5골이나 넣었지만 득점자는 2명 뿐이었으며 라힘 스털링의 해트트릭과 아게로의 멀티골이 있었습니다.
안타깝게도 부상으로 인해 이 골들이 19/20시즌 그의 마지막 골들이었습니다. 그가 선수단에서 제외되는 동안 팀은 큰 전력을 잃게 되기도 했습니다.

2019년 12월 29일, vs 셰필드 유나이티드,
프리미어리그
맨체스터 시티는 2019년 프리미어리그 마지막 경기를 위해 셰필드 유나이티드와 격돌하였으며 경기에서 케빈 데 브라이너와 세르히오 아게로가 각각 골을 넣으며 2-0 승리를 거둘 수 있었습니다.
이 경기를 Top 4 순간에 뽑은 이유는 이 골이 프리미어리그 10번째 골이었기 때문입니다. 아게로는 지난 5시즌 동안 20골 이상을 리그에서 넣고 있었고 이는 티에리 앙리와 동률 기록이기도 했습니다. 하지만 부상으로 신기록을 세울 수 없었으며 이번 시즌 16골을 넣었습니다.

2020년 1월 12일, vs 아스톤 빌라,
프리미어리그
그가 만든 또 다른 훌륭한 경기였습니다. 12번째 해트트릭을 달성하며 2개의 리스트 최상위에 그의 이름을 올려놓을 수 있었습니다. 그건 바로 프리미어리그 외국인 선수 최다득점자와 최다 해트트릭 기록이었습니다. 그의 노력은 훌륭한 결과로 이끌었고 2개의 기록은 시티팬들의 자부심에 각인될 것입니다.

2020년 3월 1일, vs 아스톤 빌라,
카라바오컵
19/20 시즌 아게로와 팀이 들어올린 2번째 트로피였습니다. City는 상대팀을 몰아붙이며 경기를 지배했고 아게로는 팀에 리드를 안겨주는 선제골을 만들어 낼 수 있었습니다. 첫 골 이후에, 로드리고는 또 다른 골을 만들어 냈고 팀은 웸블리 스타디움에서 다시 한 번 우승 트로피를 들어올리게 되었습니다.
이 대회에서 3년 연속으로 우승을 할 수 있었으며 선수들은 이보다 더 자신감이 넘칠 수 없었습니다.